Rosnąca odporność grzybów na fungicydy stała się ważnym czynnikiem ograniczającym skuteczność środków grzybobójczych w praktyce rolniczej. Presja selekcyjna wynikająca z regularnego, wieloletniego wprowadzania do środowiska środków grzybobójczych, doprowadziła do powstawania nowych szczepów grzybów patogenicznych o zwiększonej oporności na kolejne grupy związków. W chwili obecnej znanych jest kilka mechanizmów molekularnych wpływających na zmniejszenie skuteczności środków grzybobójczych. Najlepiej poznanymi są: upowszechnianie się mutacji w obrębie sekwencji kodującej białka docelowe, nadekspresja genów kodujących białka docelowe oraz adaptacja białek transportujących w kierunku zwiększonego powinowactwa do substancji o działaniu przeciwgrzybiczym.

Celem badawczym projektu jest efektywna diagnostyka zarówno specyficznej jak i szerokiej oporności na substancje grzybobójcze u fitopatogenicznych grzybów z rodzajów Septoria, Stagonospora, Pseudocercosporella, Fusarium, Erysiphe i Tapesia. Badania obejmują charakteryzację ekspresji, polimorfizmów na poziomie sekwencji (w tym polimorfizmy typu SNP) oraz przesiewowe testy diagnostyczne patogenów pochodzących z kolekcji IGR PAN oraz izolowanych z prób polowych.

Projekt ma na celu stworzenie narzędzia diagnostycznego umożliwiającego szybką, dokładną i bezpieczną analizę odporności patogenów zbożowych na stosowane środki ochrony roślin. Narzędzie to, składające się z zestawu szczegółowych procedur wykorzystujących techniki PCR, oraz qRT-PCR, pozwoli na tanią i bezpieczną analizę prób środowiskowych dostarczanych przez producentów. Wykorzystanie metod molekularnych pozwoli przy tym na znacznie szybszą diagnostykę niż obecnie stosowane metody in vitro, skracając czas analiz z kilkunastu dni do kilkunastu godzin. Zastosowanie unikatowego narzędzia umożliwi szybką reakcję hodowców na obecność odpornych patogenów, co znacznie ograniczy straty ekonomiczne i ryzyko zdrowotne.